1999年2月,中山火炬開發(fā)區(qū)黨委、管委會決心創(chuàng)建省教育強區(qū)，全力整合教育資源,把大嶺、西椏、宮花、神涌、大環(huán)、江尾頭六間小學(xué)合并而成中山火炬開發(fā)區(qū)第二小學(xué),是一所市一級小學(xué)。

　　開發(fā)區(qū)第二小學(xué)占地面積18676平方米,建校初期,學(xué)校建筑面積4470平方米,2001年由政府撥款320萬元新建成教育綜合大樓交付使用,學(xué)校建筑面積達到7312平方米。。2002年初新置了微機35臺，電腦室（60座）一套，2004年“兩機一幕”進入班級，增設(shè)了綜合電教室,音樂室,美術(shù)室,學(xué)校初具教育現(xiàn)代化規(guī)模。

　　現(xiàn)有教學(xué)班25個，學(xué)生數(shù)1301人。在編在崗教工60人，專任教師55人，其中本科學(xué)歷23人，大專學(xué)歷27人，其它學(xué)歷5人，達標率100%。35歲以下青年教師31人，50歲以上教師2人，小學(xué)高級教師33人，一級教師15人。

　　學(xué)校全面貫徹黨的教育方針，以“健康、勤奮、有信、奮進”辦學(xué)宗旨，“嚴、新、活、實”教風，全面推進實施素質(zhì)教育，建設(shè)現(xiàn)代化學(xué)校，培養(yǎng)具有開拓精神、堅強意志、崇高理想的四有新人。在少先隊活動主體性，興趣活動多樣性，課堂教學(xué)自主性中形成特色。

　　1999年,學(xué)校實行校長負責制，校長負責全面工作，黨組織保證、監(jiān)督，教職工民主管理。開發(fā)區(qū)教辦委任黃惠林同志擔任開發(fā)區(qū)二小校長,周錦連、沙泉源擔任副校長，周錦連任黨書記。內(nèi)設(shè)德育處、教導(dǎo)處、總務(wù)處。

　　2000年學(xué)校通過區(qū)一級學(xué)校驗收。

　　2002年于中山市實行人事改革制度,實行校長負責制、全員聘任制、目標責任制、結(jié)構(gòu)工資制等一系列配套改革。全區(qū)中小學(xué)校長公開競爭上崗，黃惠林同志競聘成功,繼續(xù)擔任校長,副校長周錦連同志因公調(diào)節(jié)到開發(fā)區(qū)第一小學(xué)任校長,唐聞甫通過競聘擔任副校長一職, 學(xué)校下設(shè)教導(dǎo)處、德育處、總務(wù)處三個機構(gòu)。

　　2003年唐聞甫因公調(diào)動離開二小,2003年7月,黃惠林校長退休，由黃方擔任校長、書記,沙泉源、劉光旗擔任副校長。

　　2006年副校長沙泉源同志因公調(diào)節(jié)到開發(fā)區(qū)第四小學(xué)任副校長,周麗微調(diào)入開發(fā)區(qū)二小任副校長。

　　2008年教辦對中層以上干部進行競爭上崗,開發(fā)區(qū)第二小學(xué)領(lǐng)導(dǎo)班子重新調(diào)整,黃方同志繼續(xù)擔任開發(fā)區(qū)第二小學(xué)校長,副校長周麗薇、鄭碩果。

　　2008年8月,黃方校長大力推行"扁平化"管理,學(xué)校推行扁平化管理模式，實行三級交叉式扁平化管理組織結(jié)構(gòu)。改變以往金字塔層級管理模式。做到管理重心下移，減少多層設(shè)置，以保障政令暢通這，逐步提高管理效率。按照扁平化管理模式學(xué)校將管理組織機構(gòu)設(shè)置為決策、管理、執(zhí)行三級，決策層由校長、副校長組成，管理層由副校長、年級主任組成，執(zhí)行層由年級主任、教師組成。學(xué)校中層干部任各年級主任，分管教導(dǎo)處、德育處、少先隊、工會等處室，兼任年級組長、學(xué)科組長。